截至2004年12月25日，全所科研人员在国内外公开出版的学术刊物上共发表研究论文148篇，根据我处最新统计数据显示，全部论文在SCI（“科学引文索引”）和CSCD（“中国科学引文数据库”）的收录情况如下：
　　全所SCI（全部著者）22篇，根据3个研究中心及2个支撑部门排名，其中生态中心18篇，排名1/5；藏药中心4篇，排名2/5；农业中心、标本馆及测试部均无产出。SCI（第一著者）14篇，其中生态中心11篇，人均产出0.38篇，排名1/5；藏药中心3篇，人均产出0.12篇，排名2/5。
　　CSCD（全部著者）115篇，其中生态中心54篇，排名1/5；藏药中心41篇，排名2/5；农业中心9篇，排名3/5；测试部6篇，排名4/5；标本馆5篇，排名5/5。CSCD(第一著者)100篇，其中生态中心45篇，排名1/5, 人均产出1.56篇，排名3/5；藏药中心36篇，排名2/5，人均产出1.34篇，排名4/5；农业中心8篇，排名3/5，人均产出0.89篇，排名5/5；测试部6篇，排名4/5，人均产出3.00篇，排名1/5；标本馆5篇，排名5/5，人均产出2.50篇，排名2/5。
　　全部论文按全所各创新小组论文产出（第一著者）分类排名如下：
　　其中：生态中心赵新全组论文总数21篇，排名2/10，SCI/SCIE论文2篇，排名2/10，CSCD论文15篇，排名2/10；刘建全组论文总数8篇，排名3/10，SCI/SCIE论文6篇，排名1/10，CSCD论文2篇，排名6/10；苏建平组论文总数5篇，排名5/10，SCI/SCIE论文1篇，排名3/10，CSCD论文8篇，排名3/10；周立组论文总数4篇，排名6/10，SCI/SCIE论文0篇，CSCD论文4篇，排名5/10；张耀生组论文总数4篇，并列排名6/10，SCI/SCIE论文0篇，CSCD论文4篇，并列排名5/10；农业中心张怀刚组论文总数8篇，并列排名3/10，SCI/SCIE论文0篇，CSCD论文8篇，并列排名3/10；藏药中心彭敏组论文总数2篇，排名7/10，SCI/SCIE论文2篇，并列排名2/10，CSCD论文0篇；陈桂琛组论文总数25篇，排名1/10，SCI/SCIE论文0篇，CSCD论文25篇，排名1/10；陶燕铎组论文总数4篇，并列排名6/10，SCI/SCIE论文0篇，CSCD论文4篇，并列排名5/10；龙瑞军组论文总数7篇，排名4/10，SCI/SCIE论文1篇，并列排名3/10，CSCD论文6篇，排名4/10。
　　第一著者论文被SCI/SCIE收录最多的前两位著者是：王玉金（3篇），列第一位；王环（2篇），列第二位。第一著者论文被CSCD收录最多的前六位著者是：纪兰菊（6篇），列第一位；吴玉虎（5篇），列第二位；李英年（4篇）、李天才（4篇）、马世震(4篇)、王长庭（4篇），分列第三位。
　　全部论文除SCI/SCIE、CSCD收录论文之外，正式出版的国际会议论文集收录论文4篇，其他7篇。