建所以来，球盟会官网入口共取得科研成果586项，其中153项获国家、院和省部级奖励，其中主持的“中国龙胆植物研究”科研成果获国家自然科学二等奖，“柴达木盆地白刺资源综合利用技术与产品研究开发及产业化”科研成果获国家科技进步二等奖，“三江源区草地生态恢复及可持续管理技术创新和应用”科研成果获国家科技进步二等奖，参与的“青藏铁路工程”科研成果获国家科技进步特等奖，“中国生态系统研究网络的创建及其观测研究和试验示范”科研成果获国家科技进步一等奖，“中国陆地碳收支评估的生态系统碳通量联网观测与模型模拟系统”科研成果获国家科学技术进步二等奖；发表论文6650篇；出版科研专著215部；培育农作物新品种63个；申请专利752项，授权专利435项；制定国家标准8项、地方标准79项；部分技术与产品已转让企业。在高寒草地生态学、生物资源持续高效利用和高原生态农业等重要领域中取得了丰硕的科研成果,为科技进步、地方经济建设和社会发展做出了重要贡献。